Esta cueva es una de las más extensas en todo México de acuerdo a los exámenes prolongada de más de dos kilómetros. Dentro de Loltún existen pruebas que confirman la ocupación humana, tales como los huesos recuperados de los bisontes de mamut,, gatos, y el caballo sigue siendo plehistocénico. En las paredes se pueden observar formaciones naturales y pinturas, pintado a mano con las representaciones de la técnica de humanos negativos caras pintadas en las paredes, las representaciones escultóricas, representaciones de animales y algunas figuras geométricas. algunas herramientas también fueron recuperadas.
Los mayas también utilizaron la cueva como refugio para y extraer la arcilla usada para crear utensilios . Durante el recorrido que visita las galerías y formaciones naturales conocidas localmente como : "columnas musicales, una bóveda conocida como la catedral, jaltunes, Gran Cañón, mazorca de maíz, el bebé, pinturas a mano negro, el cuarto de estalactitas y trincheras". se encontraron también restos de fauna extinta como huesos de mamut y de la vegetación diferente del actual. La ocupación en Loltún se remonta a más de 10.000 años y sirve como refugio para la guerra de castas.
