El municipio se encuentra en la parte este del Estado.
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Limita al norte con San Ildefonso Villa Alta y Santo Domingo Roayaga, al sur con San Melchor de Betaza y Totontepec Villa de Morelos, al oeste con San Cristóbal Lachirioag y San Juan Tabaa y al este con San Juan Comaltepec y Totontepec Villalde Morelos.
Coordenadas geográficas de San Andrés Yaá
33.17 de latitud norte
17°18´ de latitud oeste
Por tradición se sabe que este pueblo se fundo en el año de 1501, ignorándose quienes fueron sus primeros pobladores. El cambio de residencia de la comunidad cuentan que estuvo en un lugar llamado jaxho-bio (cerro de las pulgas) y actualmente se encuentra en una loma, la construcción y existencia de un arco que sirve de punto al río mas grande que comunica con otros pueblos. Los títulos de sus terrenos fueron expedidos por el gobierno colonial con fecha 15 de Abril de 1820.
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Puente entre Villa Alta y Temazcalapa, por norbertos
