La isla estuvo despoblada por mucho tiempo. Fue usada solamente como lugar de abrigo para los navegantes durante la temporada de nortes y turbonadas. En el año de 1762, siendo gobernador del presidio don Bernardo Sáenz Montero, unos piratas se instalaron en ella. Habían atacado un bongo que procedía del Usumacinta con mercancías y pasaje para Yucatán, les robaron todo lo que llevaban, después permanecieron en la isla estorbando la navegación. Don Bernardo, ante esa situación, envió un destacamento de hombres bien armados, en dos naves, que cayeron por sorpresa sobre los ladrones; éstos emprendieron la huida, pero la pequeña armada les dio alcance, recuperaron las mercancías y tomaron algunos prisioneros; de todo lo cual el gobernador dio aviso a algunas autoridades virreinales.
Después de este hecho, el gobernador mandó construir un pequeño fuerte, así como una torre vigía, dotando a la vez al lugar de algunas fuerzas para el cuidado de la isla. Aquéllos fueron seguramente los primeros pobladores de Isla Aguada. Para el año 1824, al iniciarse la vida independiente del país, se nombró para Isla Aguada un juez auxiliar, que lo fue el señor José María Castro; durante la Guerra de Castas de Yucatán la población aumentó, pues muchas familias que habían ido a Sabancuy encontraron en Isla Aguada mejores condiciones para desarrollarse. La resolución presidencial que dotó de ejido al pueblo fue emitida el 25 de octubre de 1923. La Villa de Isla Aguada pertenece a Ciudad del Carmen. Es decir, es una elongación ejidal de la cabecera municipal.
Isla aguada es un bello puerto de pescadores que se encuentra en el estado de Campeche entre Sabancuy y Ciudad del Carmen.
Este paraíso aun todavía virgen te ofrece un sin fín de atractivos naturales que en muy pocos lugares podrás encontrar, comenzando por la sencillez de su gente que te recibe con amabilidad y calidez , sus bellos paisajes naturales y su entorno rodeado de paz y tranquilidad, hacen que este lugar sea un paraíso natural del que no podrás dejar pasar la oportunidad de conocer y disfrutar.
Sus playas aun vírgenes te invitan a relajarte y descansar como nunca lo has hecho, por la privacidad que te ofrece es ideal para los románticos o los que buscan alejarse del estrés que la cuidada causa, su arena blanca es magnifica para recostarse y tomar el sol de una manera tan maravillosa que lo disfrutaras al máximo, además que en todo lo ancho y largo de la misma podrás recolectar hermosas conchas que podrás llevarte de recuerdo, el mar verde esmeralda es ideal para refrescarse y disfrutar de sus calmadas y poco profundas aguas que sin duda te harán revivir y dejar atrás el estrés.
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